MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 5601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021081	GAG	2	6	468322	468327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021081	CT	3	6	468362	468367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_021081	CTCC	2	8	468436	468443	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1004	NC_021081	GGC	2	6	469091	469096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_021081	GCC	2	6	469101	469106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_021081	C	6	6	469105	469110	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1007	NC_021081	CTT	2	6	470002	470007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_021081	CGCCTC	2	12	470086	470097	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_021081	CACCT	2	10	470102	470111	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1010	NC_021081	CT	3	6	470151	470156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_021081	AGG	2	6	470160	470165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_021081	CT	3	6	471781	471786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_021081	AGG	2	6	471803	471808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021081	T	7	7	473037	473043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021081	GGC	2	6	473536	473541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_021081	GCC	2	6	473546	473551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_021081	C	6	6	473550	473555	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1018	NC_021081	GGC	2	6	474392	474397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_021081	TTTTCC	2	12	474410	474421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_021081	AT	3	6	474429	474434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021081	GCGT	2	8	474443	474450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_021081	GGC	2	6	474546	474551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_021081	GCG	2	6	474578	474583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_021081	GCC	2	6	474587	474592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_021081	CTT	2	6	474596	474601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_021081	GGTGA	2	10	474604	474613	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021081	AAAGC	2	10	475235	475244	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1028	NC_021081	GCT	2	6	475245	475250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_021081	AAG	2	6	475259	475264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021081	AGG	2	6	475267	475272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021081	CGA	2	6	475282	475287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_021081	GGC	2	6	475574	475579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_021081	GCC	2	6	475584	475589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_021081	CTT	2	6	475593	475598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_021081	T	7	7	475597	475603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021081	CAC	2	6	475919	475924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_021081	AGGCCC	2	12	477604	477615	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_021081	TCGCA	2	10	477647	477656	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1039	NC_021081	GAG	2	6	477657	477662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021081	GGC	2	6	478189	478194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_021081	GCC	2	6	478199	478204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_021081	T	6	6	478208	478213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021081	T	7	7	478581	478587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021081	C	6	6	479120	479125	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1045	NC_021081	TCT	2	6	479126	479131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_021081	GCT	2	6	479150	479155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_021081	TCCCT	2	10	479170	479179	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1048	NC_021081	AGGGG	2	10	479842	479851	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021081	C	6	6	479856	479861	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1050	NC_021081	G	6	6	480131	480136	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021081	ACC	2	6	480160	480165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_021081	AACA	2	8	480182	480189	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_021081	CAGG	2	8	480203	480210	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_021081	AC	3	6	484853	484858	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_021081	ACCGA	2	10	484866	484875	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1056	NC_021081	CCT	2	6	484894	484899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_021081	TTC	2	6	487235	487240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_021081	AC	3	6	488248	488253	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_021081	GCT	2	6	489072	489077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_021081	CGA	2	6	489097	489102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_021081	CTTCAC	2	12	489203	489214	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_021081	TCT	2	6	489224	489229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_021081	AG	3	6	490927	490932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_021081	CGG	2	6	491056	491061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_021081	GGGT	2	8	491062	491069	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021081	GCG	2	6	491070	491075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_021081	TGT	2	6	491088	491093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_021081	CTC	2	6	491103	491108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_021081	C	6	6	491534	491539	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1070	NC_021081	AAC	2	6	491992	491997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_021081	CTG	2	6	492016	492021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_021081	AAAAAC	2	12	492069	492080	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1073	NC_021081	TTAT	2	8	492112	492119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021081	TTG	2	6	492124	492129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_021081	TG	3	6	492208	492213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021081	GCG	2	6	493165	493170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_021081	G	6	6	493187	493192	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021081	GC	3	6	493237	493242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_021081	GCCG	2	8	493279	493286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_021081	AGC	2	6	493340	493345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_021081	CGC	3	9	493364	493372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_021081	GCG	2	6	493375	493380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_021081	CCGT	2	8	503983	503990	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_021081	CCG	2	6	504001	504006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_021081	AACC	2	8	504050	504057	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_021081	GTAG	2	8	504264	504271	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_021081	GAGG	2	8	504322	504329	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_021081	CCT	2	6	504968	504973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_021081	TCA	2	6	505003	505008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_021081	GAG	2	6	505738	505743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_021081	CTC	2	6	505764	505769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_021081	CAAC	2	8	506306	506313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_021081	TCC	2	6	506367	506372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_021081	CCT	2	6	506823	506828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_021081	GCA	2	6	506878	506883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_021081	G	6	6	506884	506889	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_021081	CCG	2	6	506979	506984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_021081	CCCG	2	8	506991	506998	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1099	NC_021081	CTTA	2	8	507038	507045	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_021081	CACC	2	8	507721	507728	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1101	NC_021081	GCT	2	6	507742	507747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_021081	CGG	2	6	507791	507796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_021081	CTC	2	6	507799	507804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_021081	CAA	2	6	507808	507813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_021081	GAA	2	6	507858	507863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021081	CCA	2	6	507920	507925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_021081	CCCA	2	8	507957	507964	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1108	NC_021081	CTCC	2	8	509029	509036	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1109	NC_021081	CAC	2	6	510640	510645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_021081	CGG	2	6	510649	510654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_021081	G	6	6	510653	510658	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_021081	GGGT	2	8	510665	510672	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021081	GCGG	2	8	510679	510686	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_021081	CCAGAA	2	12	510699	510710	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_021081	TAAAAA	2	12	510851	510862	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021081	AGG	2	6	510887	510892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021081	ATTG	2	8	510999	511006	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_021081	GGCT	2	8	511033	511040	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_021081	TGGTT	2	10	511059	511068	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021081	GGA	2	6	511117	511122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021081	TCCA	2	8	511248	511255	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_021081	CAG	2	6	511281	511286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_021081	TAT	2	6	511294	511299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021081	GAA	2	6	511336	511341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021081	ATT	2	6	511387	511392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021081	CAC	2	6	511393	511398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_021081	GCA	2	6	511453	511458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_021081	TCC	2	6	511477	511482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_021081	AGG	2	6	511526	511531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_021081	TAC	2	6	513378	513383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_021081	ACC	2	6	513386	513391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_021081	GGA	2	6	516013	516018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021081	CGA	2	6	516079	516084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_021081	TAG	2	6	516096	516101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021081	AAT	2	6	516136	516141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_021081	TC	3	6	516164	516169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1409	NC_021081	ATC	2	6	645609	645614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_021081	ACA	2	6	645837	645842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_021081	GCTG	2	8	645881	645888	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1412	NC_021081	TAC	2	6	645916	645921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1413	NC_021081	ATC	2	6	645926	645931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1415	NC_021081	AGA	2	6	645953	645958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1419	NC_021081	CTG	2	6	648138	648143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1423	NC_021081	ACA	2	6	653075	653080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1424	NC_021081	TTA	2	6	653083	653088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1431	NC_021081	A	7	7	669290	669296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_021081	TCA	2	6	669356	669361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1436	NC_021081	CCG	2	6	673107	673112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1438	NC_021081	A	6	6	673150	673155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1440	NC_021081	GATT	2	8	673189	673196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1441	NC_021081	CCAC	2	8	674212	674219	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1442	NC_021081	CTACC	2	10	674224	674233	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1443	NC_021081	GGA	2	6	674297	674302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_021081	CCCA	2	8	704642	704649	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

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